DTU Studieprojekt - Taxonomic characterization of novel lactic acid producing bacteria

Danmarks Tekniske Universitet (DTU)

Ph.d. & forskning
Studieprojekt/speciale
Storkøbenhavn

Taxonomic characterization of novel lactic acid producing bacteria

Udbyder
Vejleder
Sted
København og omegn
Project outline
In 2018, Novozymes together with Astra ran the “Masseeksperimentet 2018”, where 25,000 Danish school students collected samples of plants, tested for presence of lactic acid producing bacteria (LAB). From 11142 samples submitted to Novozymes 3906 unique LAB isolates were identified. Most of the strains belong to already known species of LAB, but subset of these were identified by whole genome sequencing. Sequence data indicate that these represent at least 10 novel species of LAB.

In collaboration with DTU food Novozymes would like to characterize LAB strains of the novel specie to make a formal description of these species. Formal description of novel bacteria requires a publication in “International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology”. The requirements for such publication is relatively well described. The description of novel bacterial species is based on physiological and biochemical characterization of the strains as well as data indication the genomic distance to the closest related valid described bacterial species. The formal genetic basis for species distinction was based on 70% DNA/DNA homology, which when comparing whole genome sequencing translate to 95% pairwise ANI.

In this project, the novel isolates are divided into taxa based on pairwise ANI analysis. This may be supplemented with additional bioinformatic characterizations. The novel isolates are preserved in a collection in a format suitable for conducting the various test in a semi-automated manner. The assays for this need to be set up and validates using relevant benchmark strains. (Type strains of the closest relatives).

  • Technologies: Microbiology, Assays, Automation, Bioinformatics

I samarbejde med
Novozymes

Emneord

Tags
Kontakt
Virksomhed/organisation
DTU Fødevareinstituttet

Navn
Claus Heiner Bang-Berthelsen

Stilling
Seniorforsker

Mail
claban@food.dtu.dk

Vejleder-info
Kandidatuddannelsen i Bioinformatik og Systembiologi
Vejleder
Claus Heiner Bang-Berthelsen

ECTS-point
25 - 30

Type
Kandidatspeciale

Kandidatuddannelsen i Bioteknologi
Vejleder
Claus Heiner Bang-Berthelsen

ECTS-point
25 - 30

Type
Kandidatspeciale

Kandidatuddannelsen i Fødevareteknologi
Vejleder
Claus Heiner Bang-Berthelsen

ECTS-point
25 - 30

Type
Kandidatspeciale

Kandidatuddannelsen i Kemisk og Biokemisk Teknologi
Vejleder
Claus Heiner Bang-Berthelsen

ECTS-point
25 - 30

Type
Kandidatspeciale


Løbende ansøgningsfrist

Angiv venligst i din ansøgning, at du har ansøgt opslaget via Studerende Online

Ph.d. & forskning
Studieprojekt/speciale
Storkøbenhavn
Fødevarer & Veterinær
Kemi, Biotek & Materialer
Matematik, Fysik & Nano
Medicinal & Sundhed
Naturvidenskab
Produktion, Logistik & Transport
Teknik & Teknologi
Undervisning & Pædagogik
Forskning & Udvikling
Naturvidenskab
Teknik



Danmarks Tekniske Universitet (DTU) - hurtigt overblik


Danmarks Tekniske Universitet (DTU)
Danmarks Tekniske Universitet (DTU)
DTU er et teknisk eliteuniversitet med international rækkevidde og standard. Vores mission er at udvikle og nyttiggøre naturvidenskab og teknisk videnskab til gavn for samfundet. 11.200 studerende uddanner sig her til fremtiden, og 6.000 medarbejdere har hver dag fokus på uddannelse, forskning, myndighedsrådgivning og innovation, som bidrager til øget vækst og velfærd.

Placering
Anker Engelunds Vej 1
2800 Kgs. Lyngby
Logo: Danmarks Tekniske Universitet (DTU)
Efterspørgsel efter nye talenter

Hvilke jobtyper og arbejdsområder udbyder vi normalt og hvor mange nye talenter søger vi efter?


Nyeste tweets
Henter tweets...
Facebook feed

Henter facebook feed...

LinkedIn

Følg vores aktiviteter på LinkedIn.


Webside

Få mere info omkring vores virksomhed på vores egne websider:

www.dtu.dk


Danmarks Tekniske Universitet (DTU) i Google

Er der andre informationer om os, som du burde vide? Se, hvad en Google-søgning siger.



https://studerendeonline.dk/job/1285312/
Vi bruger cookies til statistik, sociale medier og brugeroplevelse. Ved at bruge sitet accepterer du vores privatlivspolitik. (luk)
HPT